O Ministério Público do Distrito Federal e Territórios entrou com uma ação civil pública de ressarcimento de R$ 210 milhões ao Estado contra os dirigentes da Novacap e empresas responsáveis pelo projeto básico e construção da Ponte JK. A empresa Via Engenharia ganhou o contrato por consórcio. O projeto inicial previa um custo de aproximadamente R$ 39 milhões para a execução da obra. Porém, o consórcio vencedor apresentou proposta de R$ 78 milhões. A Novacap era a responsável por analisar as necessidades e autorizar possíveis adicionais. Antes mesmo do início da obra, foi pedido um adicional de R$ 19 milhões, com a justificativa de que seria necessário um aumento na largura da ponte. Posteriormente foi feito novo pedido de adicional, no valor de R$ 60 milhões, com a mesma justificativa. Segundo a ação que tramita na 18ª Vara Cível do Tribunal de Justiça do DF, esse valor deverá ser devolvido.
